21-årige Tim Goodman, må tage ud på en utrolig rejse, for at løse mysteriet om sin forsvundne far, detektiven Harry Goodman. Med ham har han sin fars tidligere partner, Pokémon detektiven Pikachu. Ud over at være en fantastisk detektiv, så kan Pikachu også tale som et helt almindeligt menneske. Eller, Tim kan i hvert fald forstå ham. Sammen tager det umage makkerpar ud i verden. Men hvad der starter som et forsøg på at finde Tims forsvundne far, ender med at blive et forsøg på at redde hele Pokémon universet.